1956年四川農(nóng)學(xué)院由四川大學(xué)獨(dú)立遷至雅安建院，從四川大學(xué)數(shù)、理、化、生等基礎(chǔ)學(xué)科抽調(diào)部分骨干教師，并接收了一批全國重點大學(xué)優(yōu)秀畢業(yè)生，組建數(shù)學(xué)、物理、無機(jī)及分析化學(xué)、有機(jī)與生物化學(xué)、植物學(xué)、動物學(xué)等教研室，1960年成立了原子能農(nóng)業(yè)應(yīng)用研究室（101研究室）。這些教研室最初分別隸屬于四川農(nóng)學(xué)院農(nóng)化系、農(nóng)學(xué)系和牧醫(yī)系，1983年底上述教研室從各系分離出來成立四川農(nóng)學(xué)院基礎(chǔ)部。1985年四川農(nóng)學(xué)院更名為四川農(nóng)業(yè)大學(xué)，2003年初在原基礎(chǔ)部的理學(xué)學(xué)科基礎(chǔ)上組建了四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與理學(xué)院。

理學(xué)院于2014年3月5日由原生命科學(xué)與理學(xué)院拆分建立而成。目前設(shè)有黨委辦公室、行政辦公室、信息與計算科學(xué)系、化學(xué)生物學(xué)系、應(yīng)用化學(xué)系、應(yīng)用物理系和成都校區(qū)教學(xué)部。有生物資源化學(xué)二級學(xué)科博士、碩士學(xué)位授權(quán)點和生物與醫(yī)藥專業(yè)碩士學(xué)位點。學(xué)院現(xiàn)有專任教師81人（含返聘4人）；教授15人，副教授31人；具有博士學(xué)位的教師41人，碩士學(xué)位的教師34人；博導(dǎo)6人、碩導(dǎo)35人；省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人1人，省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人后備人選2人，省“天府峨眉計劃”青年科技人才1人；四川省優(yōu)秀教師1人，四川省師德標(biāo)兵1人，校教學(xué)名師1人，校優(yōu)秀教師標(biāo)兵1人,獲本科課堂教學(xué)質(zhì)量特等獎教師5人，留學(xué)美國、日本、加拿大、新加坡等國教師17人。有在校全日制研究生和本科生1931人，其中博士、碩士研究生167人，本科生1711人。學(xué)院的優(yōu)勢學(xué)科——化學(xué)于2022年進(jìn)入ESI全球排名前1%，是全校10個進(jìn)入此排名的學(xué)科之一。

學(xué)院承擔(dān)著全校數(shù)、理、化學(xué)科基礎(chǔ)課和化學(xué)生物學(xué)、應(yīng)用化學(xué)、信息與計算科學(xué)3個專業(yè)的專業(yè)課教學(xué)任務(wù)，現(xiàn)有省級一流本科專業(yè)1個（化學(xué)生物學(xué)），省級一流課程5門（有機(jī)化學(xué)實驗、運(yùn)籌學(xué)、大學(xué)物理、乙酰苯胺的合成及表征虛擬仿真實驗、無機(jī)及分析化學(xué)）；設(shè)有四川省科技廳基礎(chǔ)條件平臺“特色藥用植物四川省科技資源共享服務(wù)平臺”和四川省發(fā)展和改革委員會工程研究中心“四川省中藥材育繁技術(shù)工程研究中心”各1個，校級實驗教學(xué)示范中心和虛擬仿真實驗教學(xué)中心、校級數(shù)學(xué)建模指導(dǎo)中心各1個，此外，學(xué)院還設(shè)有公共實驗平臺、化學(xué)與農(nóng)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心以更好地支撐教育科研工作的發(fā)展和學(xué)生成長成才。

2014年以來，學(xué)院承擔(dān)國家、省部級及橫向合作科研課題60余項；授權(quán)專利110多項；主編、副主編數(shù)、理、化國家級和省部級規(guī)劃教材13部；獲省科技進(jìn)步二等獎1項，發(fā)表SCI收錄論文300多篇，IF大于10分 35 篇，最高IF=18.027，包括中科院一區(qū)及TOP論文200余篇，ESI高被引論文15篇。

“追求真理，學(xué)以致用”。學(xué)院始終堅持以學(xué)生為本，不斷推進(jìn)本科人才培養(yǎng)模式改革，以培養(yǎng)學(xué)術(shù)型、應(yīng)用型和復(fù)合型高素質(zhì)人才為目標(biāo)，高度重視學(xué)生綜合素質(zhì)和能力的培養(yǎng)，培養(yǎng)了眾多理論基礎(chǔ)扎實、實踐應(yīng)用能力強(qiáng)的優(yōu)秀畢業(yè)生。2014年以來，以我院本科生為第一作者、導(dǎo)師為通訊作者在國內(nèi)外重要學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表SCI收錄論文40余篇，其最高影響因子達(dá)10.618；本科學(xué)生申報獲準(zhǔn)國家級“大學(xué)生創(chuàng)新訓(xùn)練計劃”項目25項、省級23項。學(xué)院導(dǎo)師指導(dǎo)本科生在國際大學(xué)生數(shù)學(xué)建模和全國及省級數(shù)學(xué)建模競賽、“挑戰(zhàn)杯”比賽中屢獲佳績。

學(xué)院以“教學(xué)立院，科研興院”為工作理念，圍繞“穩(wěn)基礎(chǔ)、強(qiáng)專業(yè)、倡科研、承文化”的思路，以人才培養(yǎng)為中心，加強(qiáng)師資隊伍和學(xué)科專業(yè)建設(shè)，穩(wěn)定提升基礎(chǔ)課教學(xué)質(zhì)量，不斷提高人才培養(yǎng)、科學(xué)研究和社會服務(wù)能力，努力建設(shè)成數(shù)理化各學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展、專業(yè)特色突出的學(xué)院，為學(xué)校的蓬勃發(fā)展和高層次人才培養(yǎng)做出貢獻(xiàn)！