音樂學院始建于1982年，是浙江省最早開辦音樂專業本科和研究生教育的教學單位。學院秉承建校初期李叔同先生開創的“學堂樂歌”教育傳統，培養了眾多音樂教育家、作曲家、歌唱家、演奏家和近萬名的一線中小學音樂教師。2012年教育部第二次學科評估，音樂學學科列為A類學科，全國排名第15位。2014年2月學校響應浙江省人民政府決定，學院成建制劃轉成立浙江音樂學院，留下了藝術教育本科專業和藝術碩士的作曲、音樂表演、舞蹈表演、音樂教育、舞蹈教育等5個方向專業學位的研究生教育。2015年學校重建音樂教育系，并于2017年恢復音樂教育和舞蹈教育兩個本科專業的招生。2019年3月恢復成立杭州師范大學音樂學院。

學院現有音樂學、舞蹈學等2個師范類本科專業，在讀本科生490余人。2022年音樂學（師范）專業獲國家一流專業建設點，舞蹈學（師范）專業獲省級一流專業建設點。2024年兩個專業均順利通過普通高等學校師范類專業二級認證。學院現有音樂專業碩士學位授權點（專碩）和藝術學學術型碩士招生資格（學碩），在讀碩士研究生110余人。

學院現有專任教師60名，副高級及以上教師占48.33%；具有博士學位的教師比例達41.67%。學院建有標準音樂廳、小劇場、琴房大樓、美育大樓、標準舞蹈教室，總建筑面積近4萬平方米。

學院堅持“立德樹人”根本使命，秉承“盡善盡美 德藝雙成”院訓，以“為重點中小學和名校集團培養卓越的音樂舞蹈教師”為師范類專業人才培養目標，畢業生深受用人單位歡迎，連續三年本科生就業率97%以上，研究生就業率100%。近年來，學生積極參加杭州亞運會開閉幕式、火種采集儀式等重大演出任務，在全國大學生藝術展演、中國音樂小金鐘全國青少年合唱展演、全國高等藝術院校中國聲樂展演、全國普通高校音樂教育本科生基本功展示評選等國家級比賽中摘金奪銀。

近年來，學院取得了豐碩的辦學成果。獲批音樂與舞蹈藝術國家級實驗教學示范中心、浙江省非物質文化遺產傳承教學基地（傳統音樂）、杭州市哲學社會科學研究培育基地（早期藝術教育研究中心）等教學科研平臺；獲評國家社科基金、國家藝術基金等國家級和省部級科研項目20余項；研究成果獲教育部高等學校科學研究優秀成果獎（人文社會科學）、浙江省哲學社會科學優秀成果獎等；多名教師參加中央電視臺音樂頻道CCTV-15“中國音樂電視”等欄目演出錄制。