黑龍江大學教育科學研究院的前身是1988年成立的黑龍江大學高等教育研究所。2003年5月，高等教育研究所與應用心理研究所合并成立教育學院。2009年3月，黑龍江大學在教育學院基礎上整合學校相關資源成立教育科學研究院（經學校批準，同時使用教育學院一名）。

　　學院現設有教育學、應用心理學2個本科專業；擁有教育學碩士一級學科授予權，下設有教育原理、高等教育學、創業與職業3個研究方向；擁有教育碩士（教育管理）專業學位授予權、應用心理學專業學位授予權。擁有國家級文科實驗教學示范中心下屬的3個心理學實驗室；是黑龍江省教師資格培訓單位；黑龍江省高等教育質量研究基地設在我院。2012年3月，學院被中國高等教育學會評選為“第三屆全國優秀高等教育研究機構”。

　　師資隊伍優良，高級職稱教師比例為79%，擁有博士學位教師比例為74%，分別畢業于北京師范大學、華東師范大學、東北師范大學等高校，具有良好的學緣結構。學院教師科研成果豐碩，主持、參與國家級、省部級項目60余項；在《教育研究》、《心理學報》等專業領域內刊物發表文章400余篇；出版高水平學術專著30余部；獲得各級科研、教學成果獎70余項，其中國家級優秀教育教學成果獎2項，省級教學成果獎3項。有黑龍江大學學科青年學術骨干百人支持計劃人選2人;獲得黑龍江省高校系統師德先進個人、黑龍江省教學新秀獎、黑龍江省高等學校教學管理獎等榮譽稱號4人次；8名教師入選“黑龍江大學英才支持計劃”人才庫；省級精品課1門；重視實踐教學，在全省建立實習實訓基地20余個。