土木工程學(xué)院的前身有兩個源頭，一是1951年成立的綏遠(yuǎn)省高級工業(yè)學(xué)校的土木科；二是1958年成立的內(nèi)蒙古建筑學(xué)院，院黨委書記由內(nèi)蒙古建設(shè)廳廳長崔澤霖兼任，院長調(diào)原中華全國總工會海員工會副主席李大林擔(dān)任，副院長由內(nèi)蒙古建設(shè)廳副廳長曾則西兼任。內(nèi)蒙古建筑學(xué)院大學(xué)部設(shè)建筑工程系，有四年制本科和兩年制專科的工業(yè)與民用建筑專業(yè)，有四年制本科的建筑學(xué)專業(yè)。自治區(qū)政府高度重視建筑學(xué)院的建設(shè)，由清華大學(xué)對口支援內(nèi)蒙古建筑學(xué)院，將原北京市建筑科學(xué)研究所副所長鄭鈁高級工程師（清華大學(xué)土木系1938年畢業(yè)）調(diào)任建筑工程系主任；專業(yè)教師主要是來自清華大學(xué)、天津大學(xué)、南京工學(xué)院（今東南大學(xué)）、同濟(jì)大學(xué)等院校的畢業(yè)生。1961年全國院系調(diào)整時，內(nèi)蒙古建筑學(xué)院合并到內(nèi)蒙古工學(xué)院，成立建筑工程系，“文革”期間停止招生。1975年工業(yè)與民用建筑專業(yè)恢復(fù)招生，1985年開設(shè)公路與城市道路專業(yè)。隨著土木建筑學(xué)科的發(fā)展，2000年學(xué)校決定將建筑工程系更名為建筑工程學(xué)院。為了更好的促進(jìn)各專業(yè)發(fā)展，2008年學(xué)校決定將原建筑工程學(xué)院分為土木工程學(xué)院和建筑學(xué)院兩個學(xué)院，2012年土木工程專業(yè)通過住建部土木工程專業(yè)教育評估，2017年6月土木工程專業(yè)通過住建部土木工程專業(yè)教育評估（認(rèn)證）。

　　目前，土木工程學(xué)院擁有土木工程、道路橋梁與渡河工程、給排水科學(xué)與工程、建筑環(huán)境與能源應(yīng)用工程、工程管理和交通工程六個本科專業(yè)。學(xué)院還擁有工程力學(xué)二級學(xué)科博士授予權(quán)、土木工程一級學(xué)科碩士授予權(quán)，其中涵蓋巖土工程，結(jié)構(gòu)工程，供熱供燃?xì)馔L(fēng)與空調(diào)工程，防災(zāi)減災(zāi)工程及防護(hù)工程和市政工程五個二級學(xué)科碩士授予權(quán)，以及交通運(yùn)輸工程一級學(xué)科碩士授予權(quán)，包括道路與鐵道工程二級學(xué)科碩士授予權(quán)；此外還有建筑與土木工程領(lǐng)域的工程碩士授權(quán)點(diǎn)和工程管理碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。

　　學(xué)院現(xiàn)有教職工100人，其中教授13人，副教授38人，具有博士學(xué)位的教師22人，具有碩士學(xué)位的教師55人，在讀博士17人，博士生導(dǎo)師5人，碩士研究生導(dǎo)師36人。現(xiàn)有教師中許多人具有國家一級注冊結(jié)構(gòu)工程師、注冊土木（巖土）工程師、建造師、造價師、設(shè)備師、監(jiān)理工程師資格。目前在校本科學(xué)生2346人，研究生314人。

　　2005年土木工程專業(yè)被學(xué)校列為首批建設(shè)的“校級品牌專業(yè)”；2006年土木工程專業(yè)被評為“內(nèi)蒙古自治區(qū)品牌專業(yè)”；2007年和2011年，建筑環(huán)境與能源應(yīng)用工程和給排水工程科學(xué)與工程專業(yè)分別被評為“自治區(qū)品牌專業(yè)”；2008年“結(jié)構(gòu)工程”碩士點(diǎn)被列為“內(nèi)蒙古自治區(qū)重點(diǎn)學(xué)科”的培育對象。2013年建成內(nèi)蒙古自治區(qū)土木工程結(jié)構(gòu)與力學(xué)重點(diǎn)實驗室。2015年12月建筑環(huán)境與能源應(yīng)用工程專業(yè)獲評為自治區(qū)級重點(diǎn)建設(shè)專業(yè)；2017年12月學(xué)院實驗中心獲批土木工程實驗教學(xué)示范中心。2018年全國第四輪學(xué)科評估中，土木工程學(xué)科為C-檔。

　　學(xué)院實驗室建筑面積為4334平米，計算機(jī)房面積為312平米，實驗設(shè)備總價值達(dá)3106.86萬元。學(xué)院設(shè)有圖書資料室，各專業(yè)現(xiàn)行設(shè)計規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)齊全，數(shù)量充足，能夠滿足學(xué)生日常學(xué)習(xí)、課程設(shè)計和畢業(yè)設(shè)計的需求。

　　學(xué)院學(xué)術(shù)氣氛濃厚，在內(nèi)蒙古地區(qū)基本建設(shè)行業(yè)具有較大影響。不僅肩負(fù)著為自治區(qū)乃至全國培養(yǎng)工程技術(shù)人才的重任，同時承擔(dān)了多項國家級、省部級科研項目。近年來，學(xué)院教師承擔(dān)科研課題60余項；先后獲自治區(qū)自然科學(xué)獎、科技進(jìn)步獎等省部級獎項5項；在國內(nèi)外各類學(xué)術(shù)期刊和學(xué)術(shù)會議上發(fā)表科研論文160余篇，許多科研成果在工程建設(shè)中經(jīng)轉(zhuǎn)化獲得了良好的經(jīng)濟(jì)和社會效益。