復旦MBA項目（非全日制）、國際MBA和S3亞洲MBA項目有以下區別：

（1）報考要求不同：

復旦MBA項目（非全日制）：算至入學時，大專畢業后有五年及五年以上工作經驗者；本科畢業后有三年及三年以上工作經驗者；已獲碩士學位或博士學位并有二年及二年以上工作經驗者：

國際MBA/ S3亞洲MBA項目：算至入學時，本科畢業后有三年及三年以上工作經驗者（有學士學位）或已獲碩士學位或博士學位并有二年及二年以上工作經驗者。

（2）授予學位不同：

復旦MBA項目（非全日制）：復旦大學碩士研究生畢業證書和工商管理碩士學位證；（雙證）

國際MBA項目：復旦大學碩士研究生畢業證書和工商管理碩士學位證及麻省理工學院斯隆管理學院（MIT Sloan）學習證明書；（復旦雙證＋MIT學習證明書）

S3亞洲MBA項目：復旦大學研究生畢業證書和工商管理碩士學位證書，同時可以申請韓國高麗大學或新加坡國立大學工商管理碩士學位證書，以及三所大學聯合頒發的S3亞洲MBA項目學習證書。（復旦雙證＋第二個學位證）

（3）項目學制和招生人數不同：

復旦MBA項目（非全日制）：在職學習，每周1個工作日的晚上及雙休日的一天上課，中文授課為主，學制二年半，2020年計劃招生700人；

國際MBA項目：全脫產學習，周一至周五上課，全英文授課，學制二年，2020年計劃招生100人；

S3亞洲MBA項目：全脫產學習，周一至周五上課，全英文授課，學生將分別在復旦大學、高麗大學和新加坡國立大學完成一個學期的學習，學制二年，2020年計劃招生20人。

注：中央及地方黨校學歷不予承認。